安裝後，Kaspersky Endpoint Security 會將 Kaspersky 憑證新增到受信任憑證的系統儲存（Windows 憑證儲存）。Kaspersky Endpoint Security 使用該憑證掃描加密連線。Kaspersky Endpoint Security 還包括使用 Firefox 和 Thunderbird 中的受信任憑證系統儲存來掃描這些應用程式的流量。
Web 控制、郵件威脅防護和 Web 威脅防護元件可以解密和掃描透過使用以下協定建立的加密連線傳輸的網路流量：