“檔案威脅防護”元件允許您防止電腦的檔案系統受到感染。預設情況下，“檔案威脅防護”元件會永久常駐在電腦的 RAM 中。該元件將掃描電腦所有磁碟機以及連接之磁碟機上的檔案。該元件借助防毒資料庫、卡巴斯基安全網路雲端服務和啟發式分析來提供電腦防護。
該元件將掃描使用者或應用程式存取的檔案。如果偵測到惡意檔案，Kaspersky Endpoint Security 將封鎖檔案操作。應用程式隨後將根據“檔案威脅防護”元件的設定來清除或刪除惡意檔案。
當嘗試存取其內容儲存在 OneDrive 雲端中的檔案時，Kaspersky Endpoint Security 會下載並掃描檔案內容。