Kaspersky Endpoint Security のインストール中に、メール脅威対策の機能拡張が Microsoft Office Outlook（以降、「Outlook」）に組み込まれます。この機能拡張を使用して、Outlook 内からメール脅威対策の設定を開いたり、メールでウイルスなどの脅威をスキャンするタイミングを指定したりすることができます。メール脅威対策の Outlook 用機能拡張では、POP3、SMTP、NNTP、IMAP、および MAPI の各プロトコル経由で送受信されたメッセージをスキャンできます。Kaspersky Endpoint Security は、他のメールクライアント（Microsoft Outlook Express®、Windows Mail、Mozilla™Thunderbird™ など）との連携もサポートしています。
Mozilla Thunderbird メールクライアントを使用する場合、フィルターを使用してメールを［受信トレイ］フォルダーから移動すると、メール脅威対策は IMAP プロトコルで送信されるメールのウイルスなどの脅威をスキャンしません。
Outlook では、受信メッセージはまずメール脅威対策によってスキャンされ（Kaspersky Endpoint Security のインターフェイスで［POP3、SMTP、NNTP、IMAP トラフィックをスキャンする］がオンになっている場合）、次にメール脅威対策の Outlook 用機能拡張によってスキャンされます。メール脅威対策がメッセージ内で悪意のあるオブジェクトを検知すると、通知が表示されます。
Kaspersky Endpoint Security のインターフェイスで［Microsoft Outlook アドインに接続］がオンになっている場合、メール脅威対策の設定を Outlook で直接指定できます。
送信メッセージは、まずメール脅威対策の Outlook 用機能拡張によってスキャンされ、次にメール脅威対策によってスキャンされます。