Kaspersky Endpoint Security, örneğin yeni bir sertifikalandırma merkezi kullanılma almanız gerektiğinde, güvenilir kök sertifikalarını yüklemenize izin verir. Uygulama Kaspersky Endpoint Security sertifika deposuna bir sertifika eklemenize izin verir. Bu durumda, sertifika sadece Kaspersky Endpoint Security uygulaması için güvenilir kabul edilir. Başka bir deyişle, kullanıcı tarayıcıdaki yeni bir sertifika ile bir web sitesine erişim kazanabilir. Başka bir uygulamanın web sitesine erişim kazanmaya çalışması durumunda, bir sertifika sorunu nedeniyle bir bağlantı hatası alabilirsiniz. Sistem sertifika deposuna eklemek için Active Directory grubu ilkelerini kullanabilirsiniz.