Kaspersky Endpoint Security는 필요 시(새 인증 센터 배포 필요 등) 사용자 컴퓨터에 신뢰할 수 있는 루트 인증서를 설치할 수 있도록 허용합니다. 애플리케이션에서 특별한 Kaspersky Endpoint Security 인증서 스토어에 인증서를 추가할 수 있도록 허용합니다. 이때, 이 인증서는 Kaspersky Endpoint Security 애플리케이션에서만 신뢰할 수 있는 것으로 간주합니다. 다시 말해, 사용자는 브라우저에서 새 인증서가 있는 웹사이트에 액세스할 수 있습니다. 다른 애플리케이션이 해당 웹사이트에 액세스하려고 하면, 인증서 문제로 연결 오류가 발생합니다. 시스템 인증서 스토어에 추가하려면, Active Directory 그룹 정책을 사용할 수 있습니다.