Структура файла, описывающего группы синапсов

Ниже приведен пример структуры HDF5-файла, описывающего группы синапсов:

<имя_файла>.h5

┗ edges

┗ <название_проекции>

┣ source_node_id

┣ edge_group_id

┣ edge_group_index

┣ target_node_id

┣ edge_type_id

┣ indices

┃ ┣ source_to_target

┃ ┃ ┣ node_id_to_range

┃ ┃ ┗ range_to_edge_id

┃ ┗ target_to_source

┃ ┣ node_id_to_range

┃ ┗ range_to_edge_id

┗<группа_синапсов>

┣ delay

┣ syn_weight

┗ dynamics_params

В таблице ниже приведены элементы данных в файле, описывающем группы синапсов.

Элементы данных файла, описывающего группы синапсов

Элемент данных

Описание

edges

Обязательный элемент для определения групп.

<название_проекции>

Обязательный элемент, содержащий название проекции. Проекций может быть несколько.

source_node_id

Обязательный элемент, содержащий набор данных с идентификаторами пресинаптических нейронов для каждого синапса проекции.

edge_group_id

Обязательный элемент, содержащий набор данных с идентификаторами групп, к которым относятся синапсы проекции.

edge_group_index

Обязательный элемент, содержащий набор данных с индексами синапсов в соответствующих группах.

target_node_id

Обязательный элемент, содержащий набор данных с идентификаторами постсинаптических нейронов для каждого синапса проекции.

edge_type_id

Обязательный элемент, содержащий набор данных с идентификаторами типа каждого синапса проекции.

indices

Необязательный элемент для индексации синапсов по пресинаптическим и постсинаптическим нейронам.

source_to_target

Элемент, описывающий синапсы по пресинаптическим нейронам.

target_to_source

Элемент, описывающий синапсы по постсинаптическим нейронам.

node_id_to_range

Элемент, содержащий набор данных с идентификаторами пресинаптических нейронов для каждого синапса проекции.

range_to_edge_id

Элемент, содержащий набор данных с идентификаторами постсинаптических нейронов для каждого синапса проекции.

<группа_синапсов>

Обязательный элемент, содержащий идентификатор группы нейронов.

delay

Необязательный элемент, содержащий набор данных со значениями задержек синапсов группы.

syn_weight

Необязательный элемент, содержащий набор данных со значениями весов синапсов группы.

dynamics_params

Необязательные динамические атрибуты.

В начало