Yükleme sonrasında, Kaspersky Endpoint Security, Kaspersky sertifikasını güvenilir sertifikaların sistem depolamasına ekler (Windows sertifika deposu). Kaspersky Endpoint Security, şifrelenmiş bağlantıları taramak için bu sertifikayı kullanır. Kaspersky Endpoint Security ayrıca, bu uygulamaların trafiğini taramak için Firefox ve Thunderbird'te güvenilir sertifikaların sistem depolaması kullanımını kapsar.
İnternet Denetimi, Posta Tehdidi Koruması, Web Tehdidi Koruması bileşenleri, aşağıdaki iletişim kurallarını kullanarak şifrelenmiş bağlantılar üzerinden aktarılan ağ trafiğinin şifresini çözebilir ve bu ağ trafiğini tarayabilir: