Kaspersky Secure Mail Gateway wird in die vorhandene E-Mail-Infrastruktur des Unternehmens integriert und stellt kein selbständiges E-Mail-System dar. Beispielsweise, stellt Kaspersky Secure Mail Gateway keine E-Mail-Nachrichten an Empfänger zu und verwaltet keine Benutzerkonten.
Der Versand von Nachrichten zwischen Mail-Servern erfolgt mithilfe von Mail Transfer Agent. Sie können die primären und die erweiterten MTA-Einstellungen manuell in der Webschnittstelle der App anpassen.